Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms