Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem39bQ810L4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem39bQ810L4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem39bQ810L4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem39bQ810L4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem39bQ810L4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms