Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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