Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc2bQ7TPM1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms