Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms