Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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ScocQ78YZ6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms