Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vma21Q78T54 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vma21Q78T54 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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