Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubfd1Q78JW9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ubfd1Q78JW9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ubfd1Q78JW9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ubfd1Q78JW9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ubfd1Q78JW9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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