Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms