Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms