Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GcsamQ6RFH4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms