Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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