Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms