Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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