Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Krt39Q6IFX4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Krt39Q6IFX4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Krt39Q6IFX4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Krt39Q6IFX4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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