Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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