Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpd52Q62393 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpd52Q62393 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms