Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SspnQ62147 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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