Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifna11Q61716 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms