Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms