Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms