Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms