Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms