Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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