Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms