Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms