Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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