Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms