Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms