Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms