Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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