Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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