Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms