Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

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Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Shroom4Q1W617 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Shroom4Q1W617 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Shroom4Q1W617 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Shroom4Q1W617 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Shroom4Q1W617 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Shroom4Q1W617 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Shroom4Q1W617 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Shroom4Q1W617 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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Shroom4Q1W617 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms