Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms