Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms