Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms