Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms