Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrriq1Q0P5X1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrriq1Q0P5X1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrriq1Q0P5X1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrriq1Q0P5X1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Lrriq1Q0P5X1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrriq1Q0P5X1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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