Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms