Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MitfQ08874 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms