Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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