Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Calb2Q08331 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Calb2Q08331 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Calb2Q08331 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Calb2Q08331 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Calb2Q08331 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms