Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms