Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms