Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sh3bp2Q06649 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sh3bp2Q06649 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sh3bp2Q06649 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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