Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cab39Q06138 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms