Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms