Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk18Q04899 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk18Q04899 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk18Q04899 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk18Q04899 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms