Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms